Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms