Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms