Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms