Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms