Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CartptP56388 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CartptP56388 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CartptP56388 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CartptP56388 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CartptP56388 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms