Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms