Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ItgavP43406 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms