Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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