Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms