Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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