Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P20040 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P20040 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P20040 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P20040 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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