Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P18528 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P18528 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P18528 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18528 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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