Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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