Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms