Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl4M0QW46 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms