Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm20939L7N243 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm20939L7N243 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm20939L7N243 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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