Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms