Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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