Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc9a3G3X939 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms