Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm3250E9Q1M3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3250E9Q1M3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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