Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms