Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms