Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms