Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pramef6A2A8M8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pramef6A2A8M8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pramef6A2A8M8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pramef6A2A8M8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms