Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hivep3A2A884 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms