Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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