Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn8Q9Z260 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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