Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms