Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ercc4Q9QZD4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms