Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms