Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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