Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod4Q9JLH8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod4Q9JLH8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms