Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Tlr5Q9JLF7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tlr5Q9JLF7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms