Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms