Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms