Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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