Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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