Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms