Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms