Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrs1Q9CYH6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrs1Q9CYH6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms