Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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