Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ifitm3Q9CQW9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifitm3Q9CQW9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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