Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Tmed6Q9CQG0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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