Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms