Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms