Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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