Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hps4Q99KG7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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