Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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