Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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