Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms